1960 yılında Gümüşhane’de doğan Muzaffer Aytemur, Anadolu Üniversitesi İktisat Bölümü mezunudur.
Kariyerine 1985-1986 yılları arasında Trabzon Karadeniz Vergi Dairesi Müdürlüğü’nde sözleşmeli memur olarak başlamıştır. Daha sonra 1987-1990 yılları arasında özel çay fabrikalarında çalışmış, 1990–1994 yılları arasında ise Kalkınma Bankası iştiraki olan bir şirkette İdari ve Mali İşler Müdürü olarak görev yapmıştır.
1994 yılından itibaren kendi kurduğu firmasıyla Mali Müşavirlik hizmeti vermektedir. Bu alandaki faaliyetlerine devam etmektedir.
Uzun yıllardır (yaklaşık 20 yıldır) İstanbul’un Tuzla ilçesinde ikamet eden Aytemur, siyasete de burada atılmıştır. 1999 yılından itibaren Tuzla Belediye Meclis Üyesi olarak görev yapmıştır. Meclis üyeliği süresince İmar Komisyonu Üyeliği, Bütçe Komisyonu Başkanlığı, Denetim Komisyonu Başkanlığı ve Tuzla Belediye Meclisi 1. Başkan Vekilliği gibi önemli görevler üstlenmiştir. Ayrıca AK Parti grubunda Meclis Grup Başkan Vekilliği ve Tuzla Belediye Başkan Yardımcılığı görevlerinde bulunmuştur. (Not: 31 Mart 2024 yerel seçimleri sonucunda Tuzla Belediye Başkanlığı’ndaki yönetim değişikliği nedeniyle Belediye Başkan Yardımcılığı görevi sona ermiştir. Meclis üyeliği durumu ise seçim sonuçlarına göre güncellenmelidir.)
2015 yılı genel seçimlerinde Adalet ve Kalkınma Partisi’nden (AK Parti) İstanbul Milletvekili Aday Adayı olmuştur.
Ayrıca Tek Sav Vakfı Yönetim Kurulu Başkan Yardımcılığı gibi sivil toplum görevleri de bulunmaktadır.
Muzaffer Aytemur, evli ve iki çocuk babasıdır.
